{"id":847,"date":"2014-10-31T15:23:12","date_gmt":"2014-10-31T19:23:12","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo.iric.ca\/?p=847"},"modified":"2017-04-29T17:23:28","modified_gmt":"2017-04-29T21:23:28","slug":"visualisation-de-donnees-quelques-bonnes-pratiques","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/visualisation-de-donnees-quelques-bonnes-pratiques\/","title":{"rendered":"Visualisation de donn\u00e9es : quelques bonnes pratiques"},"content":{"rendered":"<p>Le <a title=\"Diagrammes de Venn: un chauchemar pour la visualisation de donn\u00e9es\" href=\"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/2014\/10\/diagrammes-de-venn-un-cauchemar-pour-la-visualisation-de-donnees\/\">dernier article de S\u00e9bastien<\/a> pr\u00e9sentait un cas de graphique particuli\u00e8rement difficile \u00e0 lire. En effet, un diagramme de Venn \u00e0 quatre ensembles repr\u00e9sente un bon exemple d&rsquo;une repr\u00e9sentation graphique qui a un peu mal tourn\u00e9.<\/p>\n<p>Les bonnes pratiques en visualisation de donn\u00e9es constituent un sujet tr\u00e8s \u00e0 la mode par les temps qui courent. Et pas seulement en sciences. Cela int\u00e9resse autant les journalistes que les analystes en intelligence d&rsquo;affaires. La foule \u00e9tait d&rsquo;ailleurs assez h\u00e9t\u00e9roclite lors de la premi\u00e8re rencontre de <a href=\"http:\/\/www.meetup.com\/vismtl\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Visualisation Montr\u00e9al<\/a> en ao\u00fbt dernier o\u00f9 plus de 100 personnes \u00e9taient pr\u00e9sentes! Et le <a href=\"https:\/\/infoactive.co\/data-design\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><em>ebook<\/em><\/a> gratuit qui a \u00e9t\u00e9 lanc\u00e9 lors de la rencontre s&rsquo;adresse autant aux\u00a0d\u00e9butants de tous les domaines.<\/p>\n<p>M\u00eame si le type de donn\u00e9es diff\u00e8re selon les domaines (on n&rsquo;a pas beaucoup de cartes g\u00e9ographiques interactives en bioinformatique!), les principes de base pour cr\u00e9er une repr\u00e9sentation r\u00e9ussie restent les m\u00eames.<\/p>\n<p>Je suis tomb\u00e9e sur un \u00e9ditorial int\u00e9ressant de Nicolas Rougier, r\u00e9cemment publi\u00e9 dans\u00a0<a href=\"http:\/\/www.ploscompbiol.org\/article\/info:doi\/10.1371\/journal.pcbi.1003833\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Plos One<\/a>, qui r\u00e9sume plusieurs bonnes pratiques en dix r\u00e8gles simples.<\/p>\n<p>Les voici (en traduction libre) :<\/p>\n<ol>\n<li>Connaissez votre public<\/li>\n<li>Identifiez votre message<\/li>\n<li>Adaptez vos figures au m\u00e9dium utilis\u00e9<\/li>\n<li>Les sous-titres ne sont pas optionnels<\/li>\n<li>Ne faites pas confiance aux param\u00e8tres par d\u00e9faut<\/li>\n<li>Utilisez la couleur efficacement<\/li>\n<li>Ne trompez pas le lecteur<\/li>\n<li>\u00c9vitez les abus (<em>\u201c<a title=\"\u00c9l\u00e9ment visuel non n\u00e9cessaire \u00e0 la compr\u00e9hension de l'information pr\u00e9sent\u00e9e dans un graphique ou qui distrait le lecteur de cette information\" href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Chartjunk\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Chartjunk<\/a>\u201d<\/em>)<\/li>\n<li>Le message passe avant la beaut\u00e9<\/li>\n<li>Utilisez les bons outils.<\/li>\n<\/ol>\n<p>Les r\u00e8gles 1 et 2 m\u00e9ritent leur place en haut de la liste. \u00a0Il est essentiel d&rsquo;avoir un message clair en t\u00eate pour cr\u00e9er une repr\u00e9sentation graphique captivante. \u00a0Et ce message doit \u00eatre clair pour nous, mais aussi pour notre public cible.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>\u00c0 vrai dire, surcharger \u00a0un graphe\u00a0et laisser le lecteur s&rsquo;arranger avec ce trop plein d&rsquo;informations est beaucoup plus facile \u00e0\u00a0faire que de d\u00e9finir clairement un message et de le pr\u00e9senter efficacement. Je parle ici par exp\u00e9rience! Prendre le temps de se demander quelles informations sont pertinentes pour\u00a0appuyer\u00a0l&rsquo;histoire que les donn\u00e9es ont \u00e0 raconter m\u00e8ne g\u00e9n\u00e9ralement \u00e0 un r\u00e9sultat beaucoup plus int\u00e9ressant. \u00a0Ici, la paresse ne paie pas!<\/p>\n<p>Allez lire l&rsquo;article, cela pourrait vous sauver du temps et des efforts dans le futur!<\/p>\n<p>Et si vous voulez vous \u00a0inspirer (et\/ou en apprendre plus), consultez les travaux d&rsquo;Edward Tufte et de John Tukey, deux pionniers dans le domaine. \u00a0Edward Tufte a, entre autres, \u00a0introduit le concept du ratio \u00ab\u00a0donn\u00e9es-vs-encre\u00a0\u00bb et a contribu\u00e9 significativement \u00e0 l&rsquo;avancement du domaine.<\/p>\n<p>Plus proche de nous, le site web de <a href=\"http:\/\/mkweb.bcgsc.ca\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Martin Krzywinski<\/a>, le cr\u00e9ateur des diagrammes <a href=\"http:\/\/circos.ca\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Circos<\/a>\u00a0vaut aussi la peine d&rsquo;\u00eatre consult\u00e9. Bonne lecture!!<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-873\" src=\"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2-244x300.jpg\" alt=\"ncomms4600-f2\" width=\"244\" height=\"300\" srcset=\"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2-244x300.jpg 244w, https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2-835x1024.jpg 835w, https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2.jpg 946w\" sizes=\"(max-width: 244px) 100vw, 244px\" \/><\/a><\/p>\n<p><strong>Figure1<\/strong>. Diagramme Circos provenant de l&rsquo;article de <a href=\"http:\/\/www.nature.com\/ncomms\/2014\/140409\/ncomms4600\/full\/ncomms4600.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Diana Paola Granados et al<\/a>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Le dernier article de S\u00e9bastien pr\u00e9sentait un cas de graphique particuli\u00e8rement difficile \u00e0 lire. En effet, un diagramme de Venn \u00e0 quatre ensembles repr\u00e9sente un bon exemple d&rsquo;une repr\u00e9sentation graphique qui a un peu mal tourn\u00e9. Les bonnes pratiques en visualisation de donn\u00e9es constituent un sujet tr\u00e8s \u00e0 la mode par les temps qui courent. Et pas seulement en sciences. Cela int\u00e9resse autant les journalistes que les analystes en intelligence d&rsquo;affaires. La foule \u00e9tait d&rsquo;ailleurs assez h\u00e9t\u00e9roclite lors de la <a href=\"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/visualisation-de-donnees-quelques-bonnes-pratiques\/\"> [&#8230;]<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":873,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jetpack_post_was_ever_published":false,"footnotes":"","jetpack_publicize_message":"","jetpack_publicize_feature_enabled":true,"jetpack_social_post_already_shared":false,"jetpack_social_options":{"image_generator_settings":{"template":"highway","default_image_id":0,"font":"","enabled":false},"version":2}},"categories":[44],"tags":[],"class_list":["post-847","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-visualisation-de-donnees"],"jetpack_publicize_connections":[],"jetpack_featured_media_url":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/wpbioinfo\/wp-content\/uploads\/2014\/10\/ncomms4600-f2.jpg","jetpack_sharing_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/847","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=847"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/847\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3273,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/847\/revisions\/3273"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/873"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=847"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=847"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo.iric.ca\/fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=847"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}