Un outil en ligne de commande développé pour classer les meilleurs gènes prédictifs (PG) et améliorer la détection des biomarqueurs. Pour cela, EPCY évalue le potentiel prédictif de chaque expression de gènes.

Publication:

Links: Git, PyPI, Docs

Un outil en ligne de commande développé pour identifier et quantifier des polymorphismes nucléotidiques, insertions, délétions et duplications à partir de données de séquençage ARN.

Publications:

Links: Git

Logiciel intégratif conçu pour fournir une interface permettant de visualiser et d’interroger de grands ensembles de données, notamment des données issues de séquençage, des dossiers cliniques et des réponses aux composés chimiques.

Publication:

  • MiSTIC, an integrated platform for the analysis of heterogeneity in large tumour transcriptome datasets. Nucleic Acids Res. 2017, https://doi.org/10.1093/nar/gkx338, PMID: 28472340

Links: Git, Public version, Demo