Analyse de survie

Les graphes de Kaplan-Meier

Lorsqu'on travaille avec des données liées au cancer, un de nos objectifs est parfois de trouver des caractéristiques (mutation, information clinique, expression génique, ...) associées au prognostic, i.e. des caractéristiques reliées à l'évolution probable de la maladie. Si c'est aussi l'un de vos objectifs, vous aurez à faire une analyse de survie.  Les analyses de survie sont constituées d'un ensemble de méthodes qui essaient de modéliser à quel moment un événement d'intérêt apparaîtra (temps d'apparition), cet événement étant souvent le [...]

By |2016-11-08T09:30:14-04:0019 février 2015|Categories: Bioinformatique, Statistiques|Tags: |0 Commentaires

lifelines (ou comment faire des analyses de survie en Python)

Depuis quelques semaines, je fais beaucoup d’analyse de survie. Je ne suis pas une experte dans ce domaine. J’ai appris la base en participant à un groupe d’étude organisé à l’interne. À chaque rencontre, nous approfondissions la matière du livre "Survival Analysis. A Self-Learning Text" de David G. Kleinbaum et Mitchel Klein. À la fin du livre, il y a du code pour aider les débutants à faire leurs premières analyses en SAS, Stata, SPSS et … R! J’ai donc [...]

By |2017-04-29T17:19:24-04:0024 mars 2014|Categories: Analyse de données, Python, Statistiques|Tags: |0 Commentaires